Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPA3P35244 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPA3P35244 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA3P35244 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA3P35244 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA3P35244 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA3P35244 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA3P35244 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA3P35244 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA3P35244 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA3P35244 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPA3P35244 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPA3P35244 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA3P35244 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms