Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd5P13379 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms