Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herc3A6H6S0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms