Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufa4Q62425 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa4Q62425 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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