Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CgnP59242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CgnP59242 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CgnP59242 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CgnP59242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CgnP59242 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CgnP59242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CgnP59242 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CgnP59242 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CgnP59242 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CgnP59242 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CgnP59242 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CgnP59242 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CgnP59242 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CgnP59242 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CgnP59242 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CgnP59242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CgnP59242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CgnP59242 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CgnP59242 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CgnP59242 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CgnP59242 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CgnP59242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CgnP59242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CgnP59242 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CgnP59242 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CgnP59242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms