Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms