Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR7P32248 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR7P32248 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR7P32248 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR7P32248 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR7P32248 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR7P32248 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR7P32248 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR7P32248 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR7P32248 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR7P32248 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR7P32248 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR7P32248 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR7P32248 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms