Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zcchc8Q9CYA6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms