Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psip1Q99JF8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms