Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim26Q3V460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim26Q3V460 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms