Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms