Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bcl11aQ9QYE3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms