Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms