Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc138Q0VF22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc138Q0VF22 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms