Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdk5r1P61809 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5r1P61809 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms