Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx28Q9CWT6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx28Q9CWT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms