Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha7Q91Y13 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms