Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pja1O55176 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Pja1O55176 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Pja1O55176 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Pja1O55176 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Pja1O55176 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pja1O55176 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja1O55176 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Pja1O55176 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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