Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sntg1Q925E1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sntg1Q925E1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sntg1Q925E1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms