Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defb12Q8K4N3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defb12Q8K4N3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defb12Q8K4N3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defb12Q8K4N3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defb12Q8K4N3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defb12Q8K4N3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb12Q8K4N3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb12Q8K4N3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defb12Q8K4N3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms