Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox4i1P19783 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox4i1P19783 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms