Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx4Q6RUU0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptx4Q6RUU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 397.8 ms