Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 DUO1YGL061C 744 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 AIR1YIL079C 1083 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.9□□□□□ -1.46
SGO1Q08490 IPI3YNL182C 1668 nt5.9□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 HSP104YLL026W 2727 nt5.9□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SFB3YHR098C 2790 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YDL114WYDL114W 927 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YDL121CYDL121C 450 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YGR283CYGR283C 1026 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YLF2YHL014C 1218 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 CTR2YHR175W 570 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 OSW5YMR148W 447 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SMF3YLR034C 1422 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 RSC2YLR357W 2670 nt5.89□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 TEL2YGR099W 2067 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YCL065WYCL065W 369 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 DIN7YDR263C 1293 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SPO74YGL170C 1242 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 OKP1YGR179C 1221 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YGR182CYGR182C 354 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 MRS1YIR021W 1092 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YLR118CYLR118C 684 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 NOP13YNL175C 1212 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 RPO26YPR187W 468 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 CLB1YGR108W 1416 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YGL036WYGL036W 2730 nt5.88□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YAP1801YHR161C 1914 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 PGK1YCR012W 1251 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YRA1YDR381W 681 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 ERG26YGL001C 1050 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 PGU1YJR153W 1086 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 ERV41YML067C 1059 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 DAL82YNL314W 768 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YOL107WYOL107W 1029 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YPR109WYPR109W 885 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SHM1YBR263W 1473 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 TNA1YGR260W 1605 nt5.87□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 JIP4YDR475C 2631 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 CRZ1YNL027W 2037 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 GUD1YDL238C 1470 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 TIM54YJL054W 1437 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 MRP13YGR084C 1020 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SAY1YGR263C 1275 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YJL215CYJL215C 360 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SPC34YKR037C 888 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YBL029WYBL029W 1131 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 RSF1YMR030W 1131 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 GLN1YPR035W 1113 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 RPL21AYBR191W 483 nt5.86□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 STE13YOR219C 2796 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 ORC5YNL261W 1440 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 NOB1YOR056C 1380 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YGR176WYGR176W 348 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 BCY1YIL033C 1251 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YML131WYML131W 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 CPA1YOR303W 1236 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.85□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 GCV1YDR019C 1203 nt5.84□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 BUD16YEL029C 939 nt5.84□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 DCP1YOL149W 696 nt5.84□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 VMA4YOR332W 702 nt5.84□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 SCT1YBL011W 2280 nt5.84□□□□□ -1.47
SGO1Q08490 GIT1YCR098C 1557 nt5.84□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SRV2YNL138W 1581 nt5.84□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SOG2YOR353C 2376 nt5.84□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 KAR1YNL188W 1302 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 TCA17YEL048C 459 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YKL151CYKL151C 1014 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YNL303WYNL303W 348 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 GPI2YPL076W 843 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YDC1YPL087W 954 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SUI3YPL237W 858 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 MGR3YMR115W 1506 nt5.83□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 APE3YBR286W 1614 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 GRX6YDL010W 696 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 ADH4YGL256W 1149 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 EPS1YIL005W 2106 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 SFT2YBL102W 648 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 TKL1YPR074C 2043 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 AMD1YML035C 2433 nt5.82□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 GIP2YER054C 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 PDR18YNR070W 4002 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 DBP9YLR276C 1785 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 PFA5YDR459C 1125 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 HAT2YEL056W 1206 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YNG2YHR090C 849 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 NVJ1YHR195W 966 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 YKL223WYKL223W 333 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 LIP2YLR239C 987 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 HRT1YOL133W 366 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 IRC14YOR135C 342 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 PRM4YPL156C 855 nt5.81□□□□□ -1.48
SGO1Q08490 NUD1YOR373W 2556 nt5.81□□□□□ -1.48
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