Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb4bP68372 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms