Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc181Q80ZU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc181Q80ZU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms