Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 ISR1YPR106W 1332 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 SVF1YDR346C 1446 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 PTR2YKR093W 1806 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 SNZ3YFL059W 897 nt6.37□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 MMS2YGL087C 414 nt6.37□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 SNZ2YNL333W 897 nt6.37□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 MLC2YPR188C 492 nt6.37□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 PGU1YJR153W 1086 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 SEC17YBL050W 879 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 YNL228WYNL228W 777 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 SUE1YPR151C 621 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 VID30YGL227W 2877 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 PPR1YLR014C 2715 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 MKC7YDR144C 1791 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 DIT1YDR403W 1611 nt6.36□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 PEX7YDR142C 1128 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 DBR1YKL149C 1218 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 SPC24YMR117C 642 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 DAL82YNL314W 768 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ELC1YPL046C 300 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 snR34snR34 203 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 FET3YMR058W 1911 nt6.35□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 BSC5YNR069C 1470 nt6.34□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ALG5YPL227C 1005 nt6.34□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 MID1YNL291C 1647 nt6.34□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 VPS5YOR069W 2028 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 VAN1YML115C 1608 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 ARP1YHR129C 1155 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 DAL3YIR032C 588 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 YLL059CYLL059C 507 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 CST6YIL036W 1764 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 SMF2YHR050W 1650 nt6.33□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 YFL042CYFL042C 2025 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 MTC5YDR128W 3447 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 COX26YDR119W-A 201 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 MAD2YJL030W 591 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 SYN8YAL014C 768 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 CAR1YPL111W 1002 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 SOG2YOR353C 2376 nt6.32□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 MRPL13YKR006C 795 nt6.31□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 RPS15YOL040C 429 nt6.31□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 HSP104YLL026W 2727 nt6.31□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 GPI18YBR004C 1302 nt6.3□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 KRE9YJL174W 831 nt6.3□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 TFS1YLR178C 660 nt6.3□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 RFA2YNL312W 822 nt6.3□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 OXP1YKL215C 3861 nt6.3□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 CLB4YLR210W 1383 nt6.3□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 YAP1801YHR161C 1914 nt6.29□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 YDL057WYDL057W 987 nt6.29□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 YKR075CYKR075C 924 nt6.29□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 PGA3YML125C 939 nt6.29□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 ENV9YOR246C 993 nt6.29□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 RAD53YPL153C 2466 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 YEH1YLL012W 1722 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 MCM6YGL201C 3054 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 CAD1YDR423C 1230 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 GFD1YMR255W 567 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 PHA2YNL316C 1005 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 CTS2YDR371W 1536 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 RTT106YNL206C 1368 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 TRK2YKR050W 2670 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 MET7YOR241W 1647 nt6.28□□□□□ -1.4
CLF1Q12309 HAS1YMR290C 1518 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YCR006CYCR006C 474 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YDL034WYDL034W 345 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 IDP1YDL066W 1287 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 MLC1YGL106W 450 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 EDC1YGL222C 528 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YKL151CYKL151C 1014 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 ADD66YKL206C 804 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YLR118CYLR118C 684 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 PDR16YNL231C 1056 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 CPA1YOR303W 1236 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 FES1YBR101C 873 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 TEF1YPR080W 1377 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 TEF2YBR118W 1377 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YEF1YEL041W 1488 nt6.27□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 SSK22YCR073C 3996 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 TIM54YJL054W 1437 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 TEA1YOR337W 2280 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YFL064CYFL064C 525 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 MED4YOR174W 855 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YPR202WYPR202W 717 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 ABZ1YNR033W 2364 nt6.26□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 RPN5YDL147W 1338 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 KNH1YDL049C 807 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YGR291CYGR291C 222 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 POS5YPL188W 1245 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 PEX32YBR168W 1242 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 BUL1YMR275C 2931 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 NSI1YDR026C 1713 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 ATP1YBL099W 1638 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 MUM3YOR298W 1440 nt6.25□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YIR007WYIR007W 2295 nt6.24□□□□□ -1.41
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