Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd1P52734 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd1P52734 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd1P52734 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms