Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psmb9P28076 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb9P28076 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms