Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp9O88851 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms