Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931423N10RikQ9D4J9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms