Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup62Q63850 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup62Q63850 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms