Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt7.58□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 URA4YLR420W 1095 nt7.58□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 TAE1YBR261C 699 nt7.58□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 PMT7YDR307W 1989 nt7.58□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 RSA4YCR072C 1548 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 GPD2YOL059W 1323 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 IXR1YKL032C 1794 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YAL064WYAL064W 285 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 SUR7YML052W 909 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 CSI1YMR025W 888 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 MTC1YJL123C 1437 nt7.57□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 TEC1YBR083W 1461 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 UIP5YKR044W 1332 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 HIM1YDR317W 1245 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YMR295CYMR295C 594 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.56□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 PRT1YOR361C 2292 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 MSS51YLR203C 1311 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 CHO1YER026C 831 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 GNA1YFL017C 480 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 CUP2YGL166W 678 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YKL071WYKL071W 771 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YLR365WYLR365W 333 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 RPL3YOR063W 1164 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 MPD1YOR288C 957 nt7.55□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 CTA1YDR256C 1548 nt7.54□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 CTF3YLR381W 2202 nt7.54□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 AIR1YIL079C 1083 nt7.54□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 UTP7YER082C 1665 nt7.54□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 UTP9YHR196W 1728 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 HED1YDR014W-A 489 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 GIC2YDR309C 1152 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 IPK1YDR315C 846 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 ASP1YDR321W 1146 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 GTT3YEL017W 1014 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 GRE3YHR104W 984 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 RSM26YJR101W 801 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YKR047WYKR047W 306 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 PRM9YAR031W 897 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 EMG1YLR186W 759 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YNL174WYNL174W 573 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 SEC62YPL094C 825 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YPL264CYPL264C 1062 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 SUT2YPR009W 807 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 YPR127WYPR127W 1038 nt7.53□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 ZWF1YNL241C 1518 nt7.52□□□□□ -1.2
SUB2Q07478 PRP2YNR011C 2631 nt7.52□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 FHL1YPR104C 2811 nt7.52□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YKR045CYKR045C 552 nt7.52□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 TMA46YOR091W 1038 nt7.52□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YOR200WYOR200W 399 nt7.52□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 SDA1YGR245C 2304 nt7.52□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PHO92YDR374C 921 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YRB2YIL063C 984 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YKL077WYKL077W 1179 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 EBP2YKL172W 1284 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YAR064WYAR064W 300 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 MRPL10YNL284C 969 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PHO85YPL031C 918 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 Q0017Q0017 162 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YHK8YHR048W 1545 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PHO12YHR215W 1404 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 Q0255Q0255 1419 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PHO11YAR071W 1404 nt7.51□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PRB1YEL060C 1908 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 NUR1YDL089W 1455 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 CAD1YDR423C 1230 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 KEG1YFR042W 603 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 SOH1YGL127C 384 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YSC83YHR017W 1158 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 SFH5YJL145W 885 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 GMH1YKR030W 822 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 RPL31BYLR406C 342 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 HAT1YPL001W 1125 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 LDB16YCL005W 771 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YMR034CYMR034C 1305 nt7.5□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDL183CYDL183C 963 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDR290WYDR290W 330 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 RPC17YJL011C 486 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 ATG16YMR159C 453 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 THI80YOR143C 960 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 snR19snR19 568 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 ASN1YPR145W 1719 nt7.49□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 DLD1YDL174C 1764 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 ATG1YGL180W 2694 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 RPC53YDL150W 1269 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 CIA2YHR122W 696 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 NSE1YLR007W 1011 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 AFG2YLR397C 2343 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 TEX1YNL253W 1269 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YPL191CYPL191C 1083 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 ICL2YPR006C 1728 nt7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms