Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top1Q04750 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top1Q04750 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Top1Q04750 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms