Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InaP46660 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InaP46660 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
InaP46660 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InaP46660 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
InaP46660 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
InaP46660 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
InaP46660 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InaP46660 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InaP46660 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
InaP46660 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InaP46660 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
InaP46660 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
InaP46660 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
InaP46660 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
InaP46660 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
InaP46660 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
InaP46660 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
InaP46660 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
InaP46660 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
InaP46660 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
InaP46660 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
InaP46660 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
InaP46660 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
InaP46660 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
InaP46660 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
InaP46660 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
InaP46660 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
InaP46660 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
InaP46660 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
InaP46660 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
InaP46660 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
InaP46660 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
InaP46660 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
InaP46660 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms