Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxa10P31310 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa10P31310 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms