Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.8□□□□□ -1.48
LRE1P25579 COX26YDR119W-A 201 nt5.8□□□□□ -1.48
LRE1P25579 TPK1YJL164C 1194 nt5.8□□□□□ -1.48
LRE1P25579 MED4YOR174W 855 nt5.8□□□□□ -1.48
LRE1P25579 VPS5YOR069W 2028 nt5.8□□□□□ -1.48
LRE1P25579 ATP1YBL099W 1638 nt5.8□□□□□ -1.48
LRE1P25579 STL1YDR536W 1710 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 QDR3YBR043C 2070 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 ARH1YDR376W 1482 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 SPO12YHR152W 522 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 PGU1YJR153W 1086 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 SPC42YKL042W 1092 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 ELA1YNL230C 1140 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 YAP1801YHR161C 1914 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 VMA2YBR127C 1554 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 BNA5YLR231C 1362 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 RTT106YNL206C 1368 nt5.79□□□□□ -1.48
LRE1P25579 MID1YNL291C 1647 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 TRK2YKR050W 2670 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 AIM3YBR108W 2844 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 YLR194CYLR194C 765 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 PGA3YML125C 939 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.78□□□□□ -1.48
LRE1P25579 SVF1YDR346C 1446 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RAI1YGL246C 1164 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 DAL3YIR032C 588 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RRT7YLL030C 342 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 GFD1YMR255W 567 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RAP1YNL216W 2484 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 UGO1YDR470C 1509 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RIO1YOR119C 1455 nt5.77□□□□□ -1.49
LRE1P25579 PMT2YAL023C 2280 nt5.76□□□□□ -1.49
LRE1P25579 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.76□□□□□ -1.49
LRE1P25579 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.76□□□□□ -1.49
LRE1P25579 CTR1YPR124W 1221 nt5.76□□□□□ -1.49
LRE1P25579 STB5YHR178W 2232 nt5.76□□□□□ -1.49
LRE1P25579 SHE10YGL228W 1734 nt5.76□□□□□ -1.49
LRE1P25579 CEF1YMR213W 1773 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 ARP2YDL029W 1176 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 CAD1YDR423C 1230 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 MLC1YGL106W 450 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 MAD2YJL030W 591 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 KRE9YJL174W 831 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 IRS4YKR019C 1848 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 NOG2YNR053C 1461 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 GUA1YMR217W 1578 nt5.75□□□□□ -1.49
LRE1P25579 IDP1YDL066W 1287 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RTT103YDR289C 1230 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 SEM1YDR363W-A 270 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 NCS6YGL211W 1080 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 OAC1YKL120W 975 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YDR132CYDR132C 1488 nt5.74□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YDL034WYDL034W 345 nt5.73□□□□□ -1.49
LRE1P25579 COS9YKL219W 1224 nt5.73□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YLL059CYLL059C 507 nt5.73□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YLR118CYLR118C 684 nt5.73□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YOL131WYOL131W 327 nt5.73□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RPO26YPR187W 468 nt5.73□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RKM4YDR257C 1485 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 PCL6YER059W 1263 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 GTO1YGR154C 1071 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 YKR075CYKR075C 924 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 PML1YLR016C 615 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RPS15YOL040C 429 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 RBD2YPL246C 789 nt5.72□□□□□ -1.49
LRE1P25579 LPL1YOR059C 1353 nt5.71□□□□□ -1.5
LRE1P25579 CAR1YPL111W 1002 nt5.71□□□□□ -1.5
LRE1P25579 CLB1YGR108W 1416 nt5.71□□□□□ -1.5
LRE1P25579 SPO77YLR341W 1434 nt5.71□□□□□ -1.5
LRE1P25579 UTP7YER082C 1665 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 YFL064CYFL064C 525 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 SCP1YOR367W 603 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 YPR202WYPR202W 717 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 SEC18YBR080C 2277 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 TIM54YJL054W 1437 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 RPT1YKL145W 1404 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 ALT1YLR089C 1779 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 PAT1YCR077C 2391 nt5.7□□□□□ -1.5
LRE1P25579 TEA1YOR337W 2280 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 YFL042CYFL042C 2025 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 KNH1YDL049C 807 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 YHP1YDR451C 1062 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 MRPL25YGR076C 474 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 MRPL13YKR006C 795 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 CBC2YPL178W 627 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 NUD1YOR373W 2556 nt5.69□□□□□ -1.5
LRE1P25579 MMR1YLR190W 1476 nt5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms