Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifrd1P19182 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms