Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01674 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01674 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01674 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01674 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01674 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01674 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01674 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01674 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01674 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01674 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01674 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01674 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01674 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01674 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01674 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01674 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01674 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01674 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01674 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01674 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms