Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Ap3b1Q9Z1T1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Ap3b1Q9Z1T1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Ap3b1Q9Z1T1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Ap3b1Q9Z1T1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Ap3b1Q9Z1T1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Ap3b1Q9Z1T1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Ap3b1Q9Z1T1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Ap3b1Q9Z1T1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ap3b1Q9Z1T1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ap3b1Q9Z1T1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Ap3b1Q9Z1T1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
Ap3b1Q9Z1T1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ap3b1Q9Z1T1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Ap3b1Q9Z1T1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ap3b1Q9Z1T1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Ap3b1Q9Z1T1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Ap3b1Q9Z1T1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Ap3b1Q9Z1T1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Ap3b1Q9Z1T1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Ap3b1Q9Z1T1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ap3b1Q9Z1T1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ap3b1Q9Z1T1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
Ap3b1Q9Z1T1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Ap3b1Q9Z1T1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Ap3b1Q9Z1T1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ap3b1Q9Z1T1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ap3b1Q9Z1T1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.44■■■■■ 4.39
Ap3b1Q9Z1T1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ap3b1Q9Z1T1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ap3b1Q9Z1T1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Ap3b1Q9Z1T1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ap3b1Q9Z1T1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ap3b1Q9Z1T1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Ap3b1Q9Z1T1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ap3b1Q9Z1T1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ap3b1Q9Z1T1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Ap3b1Q9Z1T1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Ap3b1Q9Z1T1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ap3b1Q9Z1T1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ap3b1Q9Z1T1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ap3b1Q9Z1T1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Ap3b1Q9Z1T1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ap3b1Q9Z1T1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ap3b1Q9Z1T1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms