Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sept3Q9Z1S5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sept3Q9Z1S5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sept3Q9Z1S5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Sept3Q9Z1S5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sept3Q9Z1S5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sept3Q9Z1S5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sept3Q9Z1S5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sept3Q9Z1S5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sept3Q9Z1S5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Sept3Q9Z1S5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sept3Q9Z1S5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sept3Q9Z1S5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sept3Q9Z1S5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sept3Q9Z1S5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sept3Q9Z1S5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sept3Q9Z1S5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Sept3Q9Z1S5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sept3Q9Z1S5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sept3Q9Z1S5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sept3Q9Z1S5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sept3Q9Z1S5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sept3Q9Z1S5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sept3Q9Z1S5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sept3Q9Z1S5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sept3Q9Z1S5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sept3Q9Z1S5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sept3Q9Z1S5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sept3Q9Z1S5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sept3Q9Z1S5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sept3Q9Z1S5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sept3Q9Z1S5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sept3Q9Z1S5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sept3Q9Z1S5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sept3Q9Z1S5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sept3Q9Z1S5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sept3Q9Z1S5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sept3Q9Z1S5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sept3Q9Z1S5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sept3Q9Z1S5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sept3Q9Z1S5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sept3Q9Z1S5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sept3Q9Z1S5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sept3Q9Z1S5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sept3Q9Z1S5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sept3Q9Z1S5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sept3Q9Z1S5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sept3Q9Z1S5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sept3Q9Z1S5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sept3Q9Z1S5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sept3Q9Z1S5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sept3Q9Z1S5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sept3Q9Z1S5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sept3Q9Z1S5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sept3Q9Z1S5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sept3Q9Z1S5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sept3Q9Z1S5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sept3Q9Z1S5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Sept3Q9Z1S5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sept3Q9Z1S5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sept3Q9Z1S5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sept3Q9Z1S5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sept3Q9Z1S5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sept3Q9Z1S5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sept3Q9Z1S5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sept3Q9Z1S5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sept3Q9Z1S5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sept3Q9Z1S5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sept3Q9Z1S5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sept3Q9Z1S5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sept3Q9Z1S5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sept3Q9Z1S5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sept3Q9Z1S5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sept3Q9Z1S5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sept3Q9Z1S5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sept3Q9Z1S5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sept3Q9Z1S5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sept3Q9Z1S5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sept3Q9Z1S5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sept3Q9Z1S5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sept3Q9Z1S5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sept3Q9Z1S5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sept3Q9Z1S5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Sept3Q9Z1S5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms