Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp1a4Q9WV27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp1a4Q9WV27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp1a4Q9WV27 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1a4Q9WV27 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atp1a4Q9WV27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp1a4Q9WV27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp1a4Q9WV27 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp1a4Q9WV27 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp1a4Q9WV27 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Atp1a4Q9WV27 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atp1a4Q9WV27 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atp1a4Q9WV27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atp1a4Q9WV27 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1a4Q9WV27 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp1a4Q9WV27 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atp1a4Q9WV27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atp1a4Q9WV27 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atp1a4Q9WV27 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atp1a4Q9WV27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1a4Q9WV27 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1a4Q9WV27 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Atp1a4Q9WV27 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1a4Q9WV27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp1a4Q9WV27 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp1a4Q9WV27 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1a4Q9WV27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1a4Q9WV27 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Atp1a4Q9WV27 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atp1a4Q9WV27 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp1a4Q9WV27 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atp1a4Q9WV27 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atp1a4Q9WV27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1a4Q9WV27 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1a4Q9WV27 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atp1a4Q9WV27 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Atp1a4Q9WV27 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atp1a4Q9WV27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1a4Q9WV27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atp1a4Q9WV27 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atp1a4Q9WV27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Atp1a4Q9WV27 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atp1a4Q9WV27 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atp1a4Q9WV27 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp1a4Q9WV27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp1a4Q9WV27 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp1a4Q9WV27 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1a4Q9WV27 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1a4Q9WV27 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atp1a4Q9WV27 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atp1a4Q9WV27 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atp1a4Q9WV27 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1a4Q9WV27 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1a4Q9WV27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp1a4Q9WV27 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1a4Q9WV27 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp1a4Q9WV27 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp1a4Q9WV27 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp1a4Q9WV27 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1a4Q9WV27 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1a4Q9WV27 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1a4Q9WV27 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1a4Q9WV27 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp1a4Q9WV27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1a4Q9WV27 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1a4Q9WV27 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1a4Q9WV27 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1a4Q9WV27 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp1a4Q9WV27 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1a4Q9WV27 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms