Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lhx6Q9R1R0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lhx6Q9R1R0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lhx6Q9R1R0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lhx6Q9R1R0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lhx6Q9R1R0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lhx6Q9R1R0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lhx6Q9R1R0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lhx6Q9R1R0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lhx6Q9R1R0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lhx6Q9R1R0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lhx6Q9R1R0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lhx6Q9R1R0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lhx6Q9R1R0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lhx6Q9R1R0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lhx6Q9R1R0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lhx6Q9R1R0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lhx6Q9R1R0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lhx6Q9R1R0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lhx6Q9R1R0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lhx6Q9R1R0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhx6Q9R1R0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhx6Q9R1R0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhx6Q9R1R0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lhx6Q9R1R0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lhx6Q9R1R0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lhx6Q9R1R0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lhx6Q9R1R0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lhx6Q9R1R0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lhx6Q9R1R0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lhx6Q9R1R0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lhx6Q9R1R0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lhx6Q9R1R0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lhx6Q9R1R0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lhx6Q9R1R0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lhx6Q9R1R0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lhx6Q9R1R0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lhx6Q9R1R0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lhx6Q9R1R0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lhx6Q9R1R0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lhx6Q9R1R0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lhx6Q9R1R0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lhx6Q9R1R0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lhx6Q9R1R0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lhx6Q9R1R0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lhx6Q9R1R0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lhx6Q9R1R0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lhx6Q9R1R0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lhx6Q9R1R0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lhx6Q9R1R0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx6Q9R1R0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lhx6Q9R1R0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lhx6Q9R1R0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhx6Q9R1R0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lhx6Q9R1R0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lhx6Q9R1R0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lhx6Q9R1R0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lhx6Q9R1R0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lhx6Q9R1R0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lhx6Q9R1R0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lhx6Q9R1R0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lhx6Q9R1R0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lhx6Q9R1R0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lhx6Q9R1R0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lhx6Q9R1R0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lhx6Q9R1R0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lhx6Q9R1R0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lhx6Q9R1R0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lhx6Q9R1R0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lhx6Q9R1R0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhx6Q9R1R0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhx6Q9R1R0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms