Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpc1Q9QZF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpc1Q9QZF2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpc1Q9QZF2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpc1Q9QZF2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpc1Q9QZF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpc1Q9QZF2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpc1Q9QZF2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc1Q9QZF2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpc1Q9QZF2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpc1Q9QZF2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpc1Q9QZF2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpc1Q9QZF2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gpc1Q9QZF2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gpc1Q9QZF2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gpc1Q9QZF2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpc1Q9QZF2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpc1Q9QZF2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc1Q9QZF2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpc1Q9QZF2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gpc1Q9QZF2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gpc1Q9QZF2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpc1Q9QZF2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gpc1Q9QZF2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gpc1Q9QZF2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gpc1Q9QZF2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpc1Q9QZF2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gpc1Q9QZF2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc1Q9QZF2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gpc1Q9QZF2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gpc1Q9QZF2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpc1Q9QZF2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpc1Q9QZF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpc1Q9QZF2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpc1Q9QZF2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpc1Q9QZF2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpc1Q9QZF2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpc1Q9QZF2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gpc1Q9QZF2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpc1Q9QZF2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gpc1Q9QZF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc1Q9QZF2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpc1Q9QZF2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc1Q9QZF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc1Q9QZF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gpc1Q9QZF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gpc1Q9QZF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gpc1Q9QZF2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpc1Q9QZF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpc1Q9QZF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpc1Q9QZF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gpc1Q9QZF2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gpc1Q9QZF2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gpc1Q9QZF2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc1Q9QZF2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc1Q9QZF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpc1Q9QZF2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gpc1Q9QZF2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gpc1Q9QZF2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpc1Q9QZF2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gpc1Q9QZF2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gpc1Q9QZF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpc1Q9QZF2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gpc1Q9QZF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc1Q9QZF2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpc1Q9QZF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpc1Q9QZF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc1Q9QZF2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpc1Q9QZF2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpc1Q9QZF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpc1Q9QZF2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc1Q9QZF2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc1Q9QZF2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc1Q9QZF2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc1Q9QZF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc1Q9QZF2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpc1Q9QZF2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpc1Q9QZF2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gpc1Q9QZF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc1Q9QZF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc1Q9QZF2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc1Q9QZF2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gpc1Q9QZF2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gpc1Q9QZF2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpc1Q9QZF2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms