Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfhx4Q9JJN2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfhx4Q9JJN2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfhx4Q9JJN2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfhx4Q9JJN2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfhx4Q9JJN2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfhx4Q9JJN2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfhx4Q9JJN2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfhx4Q9JJN2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfhx4Q9JJN2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfhx4Q9JJN2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfhx4Q9JJN2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfhx4Q9JJN2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfhx4Q9JJN2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfhx4Q9JJN2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfhx4Q9JJN2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfhx4Q9JJN2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfhx4Q9JJN2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfhx4Q9JJN2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfhx4Q9JJN2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfhx4Q9JJN2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfhx4Q9JJN2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfhx4Q9JJN2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfhx4Q9JJN2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfhx4Q9JJN2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfhx4Q9JJN2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfhx4Q9JJN2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfhx4Q9JJN2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfhx4Q9JJN2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfhx4Q9JJN2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfhx4Q9JJN2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfhx4Q9JJN2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfhx4Q9JJN2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfhx4Q9JJN2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfhx4Q9JJN2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfhx4Q9JJN2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfhx4Q9JJN2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfhx4Q9JJN2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfhx4Q9JJN2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zfhx4Q9JJN2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zfhx4Q9JJN2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zfhx4Q9JJN2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfhx4Q9JJN2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfhx4Q9JJN2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zfhx4Q9JJN2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zfhx4Q9JJN2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zfhx4Q9JJN2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfhx4Q9JJN2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfhx4Q9JJN2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfhx4Q9JJN2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfhx4Q9JJN2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfhx4Q9JJN2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfhx4Q9JJN2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfhx4Q9JJN2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfhx4Q9JJN2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfhx4Q9JJN2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfhx4Q9JJN2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfhx4Q9JJN2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfhx4Q9JJN2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfhx4Q9JJN2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfhx4Q9JJN2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfhx4Q9JJN2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfhx4Q9JJN2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfhx4Q9JJN2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfhx4Q9JJN2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfhx4Q9JJN2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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