Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnmb4Q9JIN6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnmb4Q9JIN6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnmb4Q9JIN6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnmb4Q9JIN6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnmb4Q9JIN6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnmb4Q9JIN6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnmb4Q9JIN6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnmb4Q9JIN6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnmb4Q9JIN6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnmb4Q9JIN6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnmb4Q9JIN6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnmb4Q9JIN6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnmb4Q9JIN6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnmb4Q9JIN6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnmb4Q9JIN6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnmb4Q9JIN6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnmb4Q9JIN6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnmb4Q9JIN6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnmb4Q9JIN6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnmb4Q9JIN6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnmb4Q9JIN6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnmb4Q9JIN6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnmb4Q9JIN6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnmb4Q9JIN6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnmb4Q9JIN6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnmb4Q9JIN6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnmb4Q9JIN6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnmb4Q9JIN6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnmb4Q9JIN6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnmb4Q9JIN6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnmb4Q9JIN6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnmb4Q9JIN6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnmb4Q9JIN6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnmb4Q9JIN6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnmb4Q9JIN6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnmb4Q9JIN6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnmb4Q9JIN6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnmb4Q9JIN6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnmb4Q9JIN6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnmb4Q9JIN6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnmb4Q9JIN6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnmb4Q9JIN6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnmb4Q9JIN6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnmb4Q9JIN6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnmb4Q9JIN6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnmb4Q9JIN6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnmb4Q9JIN6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnmb4Q9JIN6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnmb4Q9JIN6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnmb4Q9JIN6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnmb4Q9JIN6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnmb4Q9JIN6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnmb4Q9JIN6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnmb4Q9JIN6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnmb4Q9JIN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnmb4Q9JIN6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnmb4Q9JIN6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnmb4Q9JIN6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnmb4Q9JIN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnmb4Q9JIN6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnmb4Q9JIN6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnmb4Q9JIN6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnmb4Q9JIN6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnmb4Q9JIN6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnmb4Q9JIN6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnmb4Q9JIN6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms