Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE4

Gal3st1, Galactosylceramide sulfotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st1Q9JHE4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gal3st1Q9JHE4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gal3st1Q9JHE4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gal3st1Q9JHE4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gal3st1Q9JHE4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gal3st1Q9JHE4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gal3st1Q9JHE4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gal3st1Q9JHE4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gal3st1Q9JHE4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gal3st1Q9JHE4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gal3st1Q9JHE4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gal3st1Q9JHE4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gal3st1Q9JHE4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gal3st1Q9JHE4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gal3st1Q9JHE4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gal3st1Q9JHE4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gal3st1Q9JHE4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gal3st1Q9JHE4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gal3st1Q9JHE4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gal3st1Q9JHE4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gal3st1Q9JHE4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gal3st1Q9JHE4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gal3st1Q9JHE4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gal3st1Q9JHE4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gal3st1Q9JHE4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gal3st1Q9JHE4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gal3st1Q9JHE4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gal3st1Q9JHE4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gal3st1Q9JHE4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gal3st1Q9JHE4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gal3st1Q9JHE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gal3st1Q9JHE4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gal3st1Q9JHE4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gal3st1Q9JHE4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gal3st1Q9JHE4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gal3st1Q9JHE4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gal3st1Q9JHE4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gal3st1Q9JHE4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gal3st1Q9JHE4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gal3st1Q9JHE4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gal3st1Q9JHE4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gal3st1Q9JHE4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gal3st1Q9JHE4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gal3st1Q9JHE4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gal3st1Q9JHE4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gal3st1Q9JHE4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gal3st1Q9JHE4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gal3st1Q9JHE4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gal3st1Q9JHE4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gal3st1Q9JHE4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gal3st1Q9JHE4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gal3st1Q9JHE4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gal3st1Q9JHE4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gal3st1Q9JHE4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gal3st1Q9JHE4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gal3st1Q9JHE4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gal3st1Q9JHE4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gal3st1Q9JHE4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gal3st1Q9JHE4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gal3st1Q9JHE4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gal3st1Q9JHE4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gal3st1Q9JHE4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gal3st1Q9JHE4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gal3st1Q9JHE4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gal3st1Q9JHE4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gal3st1Q9JHE4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gal3st1Q9JHE4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gal3st1Q9JHE4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gal3st1Q9JHE4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gal3st1Q9JHE4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gal3st1Q9JHE4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gal3st1Q9JHE4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gal3st1Q9JHE4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 972.4 ms