Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atg7Q9D906 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atg7Q9D906 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Atg7Q9D906 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atg7Q9D906 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atg7Q9D906 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg7Q9D906 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atg7Q9D906 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atg7Q9D906 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg7Q9D906 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg7Q9D906 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atg7Q9D906 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Atg7Q9D906 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atg7Q9D906 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atg7Q9D906 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg7Q9D906 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atg7Q9D906 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atg7Q9D906 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atg7Q9D906 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Atg7Q9D906 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atg7Q9D906 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atg7Q9D906 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atg7Q9D906 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atg7Q9D906 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atg7Q9D906 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atg7Q9D906 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atg7Q9D906 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atg7Q9D906 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atg7Q9D906 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atg7Q9D906 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atg7Q9D906 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atg7Q9D906 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atg7Q9D906 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atg7Q9D906 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atg7Q9D906 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Atg7Q9D906 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atg7Q9D906 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg7Q9D906 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg7Q9D906 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg7Q9D906 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atg7Q9D906 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atg7Q9D906 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg7Q9D906 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atg7Q9D906 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atg7Q9D906 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atg7Q9D906 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg7Q9D906 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg7Q9D906 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg7Q9D906 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg7Q9D906 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg7Q9D906 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg7Q9D906 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg7Q9D906 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg7Q9D906 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg7Q9D906 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg7Q9D906 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg7Q9D906 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atg7Q9D906 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atg7Q9D906 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atg7Q9D906 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg7Q9D906 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg7Q9D906 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg7Q9D906 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg7Q9D906 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg7Q9D906 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg7Q9D906 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg7Q9D906 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg7Q9D906 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg7Q9D906 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg7Q9D906 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg7Q9D906 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg7Q9D906 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg7Q9D906 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg7Q9D906 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg7Q9D906 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg7Q9D906 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg7Q9D906 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atg7Q9D906 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg7Q9D906 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atg7Q9D906 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg7Q9D906 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg7Q9D906 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg7Q9D906 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg7Q9D906 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atg7Q9D906 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg7Q9D906 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atg7Q9D906 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atg7Q9D906 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atg7Q9D906 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atg7Q9D906 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atg7Q9D906 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms