Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Arpc5lQ9D898 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arpc5lQ9D898 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arpc5lQ9D898 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arpc5lQ9D898 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arpc5lQ9D898 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arpc5lQ9D898 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arpc5lQ9D898 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arpc5lQ9D898 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arpc5lQ9D898 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Arpc5lQ9D898 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arpc5lQ9D898 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arpc5lQ9D898 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arpc5lQ9D898 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arpc5lQ9D898 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arpc5lQ9D898 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arpc5lQ9D898 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arpc5lQ9D898 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arpc5lQ9D898 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arpc5lQ9D898 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arpc5lQ9D898 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arpc5lQ9D898 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arpc5lQ9D898 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arpc5lQ9D898 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arpc5lQ9D898 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arpc5lQ9D898 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arpc5lQ9D898 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arpc5lQ9D898 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arpc5lQ9D898 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arpc5lQ9D898 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arpc5lQ9D898 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arpc5lQ9D898 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arpc5lQ9D898 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arpc5lQ9D898 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arpc5lQ9D898 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arpc5lQ9D898 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arpc5lQ9D898 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arpc5lQ9D898 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arpc5lQ9D898 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arpc5lQ9D898 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arpc5lQ9D898 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arpc5lQ9D898 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arpc5lQ9D898 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arpc5lQ9D898 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arpc5lQ9D898 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arpc5lQ9D898 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arpc5lQ9D898 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arpc5lQ9D898 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arpc5lQ9D898 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arpc5lQ9D898 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arpc5lQ9D898 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arpc5lQ9D898 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arpc5lQ9D898 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arpc5lQ9D898 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arpc5lQ9D898 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arpc5lQ9D898 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms