Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pramef12Q9D2F1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pramef12Q9D2F1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pramef12Q9D2F1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pramef12Q9D2F1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pramef12Q9D2F1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pramef12Q9D2F1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pramef12Q9D2F1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Pramef12Q9D2F1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pramef12Q9D2F1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pramef12Q9D2F1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pramef12Q9D2F1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pramef12Q9D2F1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pramef12Q9D2F1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pramef12Q9D2F1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pramef12Q9D2F1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pramef12Q9D2F1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pramef12Q9D2F1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pramef12Q9D2F1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pramef12Q9D2F1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pramef12Q9D2F1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pramef12Q9D2F1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pramef12Q9D2F1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Pramef12Q9D2F1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pramef12Q9D2F1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pramef12Q9D2F1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pramef12Q9D2F1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pramef12Q9D2F1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pramef12Q9D2F1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pramef12Q9D2F1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pramef12Q9D2F1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pramef12Q9D2F1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pramef12Q9D2F1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pramef12Q9D2F1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pramef12Q9D2F1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pramef12Q9D2F1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pramef12Q9D2F1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pramef12Q9D2F1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pramef12Q9D2F1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pramef12Q9D2F1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pramef12Q9D2F1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pramef12Q9D2F1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Pramef12Q9D2F1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pramef12Q9D2F1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pramef12Q9D2F1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pramef12Q9D2F1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pramef12Q9D2F1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pramef12Q9D2F1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pramef12Q9D2F1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pramef12Q9D2F1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pramef12Q9D2F1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pramef12Q9D2F1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pramef12Q9D2F1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pramef12Q9D2F1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pramef12Q9D2F1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pramef12Q9D2F1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pramef12Q9D2F1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Pramef12Q9D2F1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pramef12Q9D2F1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pramef12Q9D2F1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pramef12Q9D2F1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pramef12Q9D2F1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pramef12Q9D2F1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pramef12Q9D2F1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pramef12Q9D2F1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Pramef12Q9D2F1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pramef12Q9D2F1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pramef12Q9D2F1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pramef12Q9D2F1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pramef12Q9D2F1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pramef12Q9D2F1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pramef12Q9D2F1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pramef12Q9D2F1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pramef12Q9D2F1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pramef12Q9D2F1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pramef12Q9D2F1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pramef12Q9D2F1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pramef12Q9D2F1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pramef12Q9D2F1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pramef12Q9D2F1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms