Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhl35Q9CZ49 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klhl35Q9CZ49 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl35Q9CZ49 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhl35Q9CZ49 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhl35Q9CZ49 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhl35Q9CZ49 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Klhl35Q9CZ49 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhl35Q9CZ49 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhl35Q9CZ49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhl35Q9CZ49 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klhl35Q9CZ49 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Klhl35Q9CZ49 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Klhl35Q9CZ49 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Klhl35Q9CZ49 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Klhl35Q9CZ49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Klhl35Q9CZ49 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Klhl35Q9CZ49 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Klhl35Q9CZ49 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klhl35Q9CZ49 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Klhl35Q9CZ49 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klhl35Q9CZ49 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Klhl35Q9CZ49 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl35Q9CZ49 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl35Q9CZ49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Klhl35Q9CZ49 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhl35Q9CZ49 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl35Q9CZ49 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Klhl35Q9CZ49 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Klhl35Q9CZ49 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhl35Q9CZ49 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klhl35Q9CZ49 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klhl35Q9CZ49 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klhl35Q9CZ49 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klhl35Q9CZ49 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klhl35Q9CZ49 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Klhl35Q9CZ49 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klhl35Q9CZ49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klhl35Q9CZ49 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl35Q9CZ49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Klhl35Q9CZ49 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klhl35Q9CZ49 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Klhl35Q9CZ49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klhl35Q9CZ49 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klhl35Q9CZ49 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klhl35Q9CZ49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klhl35Q9CZ49 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klhl35Q9CZ49 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klhl35Q9CZ49 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klhl35Q9CZ49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klhl35Q9CZ49 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Klhl35Q9CZ49 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Klhl35Q9CZ49 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klhl35Q9CZ49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klhl35Q9CZ49 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klhl35Q9CZ49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klhl35Q9CZ49 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klhl35Q9CZ49 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl35Q9CZ49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klhl35Q9CZ49 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klhl35Q9CZ49 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klhl35Q9CZ49 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klhl35Q9CZ49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klhl35Q9CZ49 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klhl35Q9CZ49 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl35Q9CZ49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl35Q9CZ49 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl35Q9CZ49 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klhl35Q9CZ49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhl35Q9CZ49 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klhl35Q9CZ49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klhl35Q9CZ49 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Klhl35Q9CZ49 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klhl35Q9CZ49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klhl35Q9CZ49 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klhl35Q9CZ49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klhl35Q9CZ49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl35Q9CZ49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl35Q9CZ49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl35Q9CZ49 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Klhl35Q9CZ49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klhl35Q9CZ49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl35Q9CZ49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Klhl35Q9CZ49 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Klhl35Q9CZ49 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klhl35Q9CZ49 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Klhl35Q9CZ49 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Klhl35Q9CZ49 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Klhl35Q9CZ49 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl35Q9CZ49 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228 ms